F. Güzin Ağca-Varoğlu erwarb ihren Masterabschluss an der Freien Universität Berlin mit ihrer Arbeit über die Effekte von Stereotypisierung auf die Identitätsbildung der hochqualifizierten Migranten in Deutschland, nachdem sie ihr Bachelorstudium an der Hacettepe-Universität, am Fachbereich Soziologie, abgeschlossen hat. Sie führte unter der Betreeung von Prof. Dr. Werner Schiffauer eine ethnographische Langzeitstudie mit dem Titel „Auf dem Weg der Liebenden": Eine ethnographische Studie über die deutschstämmigen Muslime in den Sufi-Gemeinden durch, in der sie Sufi-Gemeinden deutscher Konvertiten und ihren nachkommenden Generationen in verschiedenen Städten und Dörfern Deutschlands untersucht hat. Mit dieser Arbeit promovierte sie 2018 am Vergleichenden Kultur- und Sozialanthropologie mit Magna cum laude. Ihre Interessensgebiete liegen in der Islam- und Migrationsforschung in Deutschland, Alltag- und Raumsoziologie. Zu diesen Themen liegen wissenschaftliche Arbeiten, Aufsätze und Vorträge von ihr vor. Darüber hinaus lehrte sie in der Türkei und in Deutschland. Sie ist verheiratet und hat zwei Kinder.