Assoc. Prof. Dr.
Orkide COŞKUNER WEBER

Fakultät für Naturwissenschaften

Molekulare Biotechnologie

Lebenslauf

Ausbildung

2000 - 2003
Doktor

Universität zu Köln

Fizikokimya
1996 - 2000
Master

Universitaet zu Köln

Kimya
1990 - 1996
Bachelor

ORTA DOĞU TEKNİK ÜNİVERSİTESİ

FEN-EDEBİYAT FAKÜLTESİ, KİMYA BÖLÜMÜ

Akademischer Titel

2019
Dozent

TÜRK-ALMAN ÜNİVERSİTESİ,

FEN FAKÜLTESİ, MOLEKÜLER BİYOTEKNOLOJİ BÖLÜMÜ
2017
Assistenzprofessor

TÜRK-ALMAN ÜNİVERSİTESİ,

FEN FAKÜLTESİ, MOLEKÜLER BİYOTEKNOLOJİ BÖLÜMÜ
2014
Assistenzprofessor

NIST, AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ

Sciences, Chemistry
2009
Assistenzprofessor

University of Texas at San Antonio, AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ

Sciences, Chemistry
2008
Lehrbeauftragte (r)

Georgetown University, AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ

Sciences, Chemistry
2007
Assistenzprofessor

George Mason University, AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ

Engineering, Materials Science and Engineering
2005
Lehrbeauftragte (r)

Stanford University, AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ

Sciences, SSRL
2003
Lehrbeauftragte (r)

Johns Hopkins University, AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ

Engineering, Chemical and Biomolecular Engineering
1999
Wissenschaftliche (r) Mitarbeiter (in)

Universitaet zu Köln, ALMANYA

Naturwissenschaften, Chemie

Akademische Studien

  • International

    (2024) Structures prediction and replica exchange molecular dynamics simulations of α-synuclein: A case study for intrinsically disordered proteins

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: International Journal of Biological Macromolecules, Anzahl der Autoren: 1, Monat: September, Sprache: Englisch, Band: 276, Doi: 10.1016/j.ijbiomac.2024.133813, ISSN: 0141-8130, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: http://dx.doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2024.133813 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Biyoloji>Biyoteknoloji, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2024) Liquid-Liquid Phase Separation Associated with Intrinsically Disordered Proteins: Experimental and Computational Tools

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Uversky Vladimir N., Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Current Protein & Peptide Science, Anzahl der Autoren: 2, Monat: Juli, Sprache: Englisch, Band: 25, Doi: 10.2174/0113892037314062240618193044, ISSN: 1389-2037, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: http://dx.doi.org/10.2174/0113892037314062240618193044 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Biyoloji>Biyoteknoloji, Artikeltyp: Rezension,

    (2024) Intrinsically Disordered Proteins by Homology Modeling and Replica Exchange Molecular Dynamics Simulations: A Case Study of Amyloid-β42

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: TR DİZİN, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Journal of the Turkish Chemical Society Section A: Chemistry, Anzahl der Autoren: 1, Monat: Juni, Sprache: Englisch, Doi: 10.18596/jotcsa.1457169, ISSN: 2149-0120, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: http://dx.doi.org/10.18596/jotcsa.1457169 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Biyoloji>Biyoteknoloji, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2024) Structural Properties of Rat Intestinal Fatty Acid-Binding Protein with its Dynamics: Insights into Intrinsic Disorder

    Autor: Ballı Öykü İrem, Caglayan Sule Irem, Uversky Vladimir, COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Protein & Peptide Letters, Anzahl der Autoren: 4, Monat: Juni, Sprache: Englisch, Band: 31, Doi: 10.2174/0109298665313811240530055004, ISSN: 0929-8665, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: http://dx.doi.org/10.2174/0109298665313811240530055004 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Biyoloji>Biyoteknoloji, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2024) Current Stage and Future Perspectives for Homology Modeling, Molecular Dynamics Simulations, Machine Learning with Molecular Dynamics, and Quantum Computing for Intrinsically Disordered Proteins and Proteins with Intrinsically Disordered Regions

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Uversky Vladimir N., Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Current Protein & Peptide Science, Anzahl der Autoren: 2, Monat: Februar, Sprache: Englisch, Band: 25, Doi: 10.2174/0113892037281184231123111223, ISSN: 1389-2037, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: http://dx.doi.org/10.2174/0113892037281184231123111223 , Fachwissen: Mühendislik Temel Alanı>Bilgisayar Bilimleri ve Mühendisliği>Biyoenformatik>Kuantum Hesaplama>Algoritmalar ve Hesaplama Kuramı>icsel düzensiz proteinler , Artikeltyp: Originalartikel,

    (2023) The impacts of the mitochondrial myopathy-associated G58R mutation on the dynamic structural properties of CHCHD10

    Autor: ALICI HAKAN, Uversky Vladimir N., Kang David, Woo Junga Alexa, COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS, Anzahl der Autoren: 5, Monat: Juni, Sprache: Englisch, Doi: 10.1080/07391102.2023.2227713, ISSN: 0739-1102, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: http://dx.doi.org/10.1080/07391102.2023.2227713 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Moleküler Biyoloji ve Genetik>Moleküler Biyoloji>Biyoteknoloji, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2023) Frontotemporal Dementia-Related V57E Mutation Impairs Mitochondrial Function and Alters the Structural Properties of CHCHD10

    Autor: ALICI HAKAN, Uversky Vladimir N., Liu Tian, Kang David, woo junga alexa, COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: ACS Chemical Neuroscience, Anzahl der Autoren: 6, Monat: Mai, Sprache: Englisch, Band: 14, Seite: 2134-2145, Doi: 10.1021/acschemneuro.3c00125, ISSN: 1948-7193, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: http://dx.doi.org/10.1021/acschemneuro.3c00125 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Moleküler Biyoloji ve Genetik>Moleküler Biyoloji>Biyoteknoloji>Genetik, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2023) Intrinsically Disordered Synthetic Polymers in Biomedical Applications

    Autor: Yüce Eraraslan Elif, Domb Abraham J., Kasem Haytam, Uversky Vladimir N., COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Polymers, Anzahl der Autoren: 5, Monat: Mai, Sprache: Englisch, Band: 15, Seite: 2406-, Doi: 10.3390/polym15102406, ISSN: 2073-4360, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: http://dx.doi.org/10.3390/polym15102406 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Kimya>Polimer Bilimi, Artikeltyp: Rezension,

    (2023) Paving the Way for Synthetic Intrinsically Disordered Polymers for Soft Robotics

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, YÜCE ELİF, Uversky Vladimir N., Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Polymers, Anzahl der Autoren: 3, Monat: Februar, Sprache: Englisch, Band: 15, Doi: 10.3390/polym15030763, ISSN: 2073-4360, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: http://dx.doi.org/10.3390/polym15030763 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Kimya>Polimer Bilimi, Artikeltyp: Rezension,

    (2023) Effects of the Jokela type of spinal muscular atrophy‐related G66V mutation on the structural ensemble characteristics of CHCHD10

    Autor: ALICI HAKAN, Uversky Vladimir N., Kang David, woo junga alexa, COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, Anzahl der Autoren: 5, Monat: Januar, Sprache: Englisch, Band: 91, Doi: 10.1002/prot.26463, ISSN: 0887-3585, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: http://dx.doi.org/10.1002/prot.26463 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Kimya>Teorik Kimya>Fiziksel Kimya>Fiziksel Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2022) Insights into the structural properties of SARS-CoV-2 main protease

    Autor: Akbayrak Ibrahim Yagiz, Caglayan Sule Irem, Uversky Vladimir N., Kurgan Lukasz, COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: İlgili alanda önde gelen ülkelerin hakemli bilimsel/mesleki dergilerinde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Elsevier BV, Anzahl der Autoren: 5, Monat: Dezember, Sprache: Englisch, Band: 4, Seite: 349-355, Doi: 10.1016/j.crstbi.2022.11.001, ISSN: 2665-928X, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: http://dx.doi.org/10.1016/j.crstbi.2022.11.001 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Biyoloji>Biyoteknoloji>Biyokimya>Biyo-enformatik>Sars CoV-2, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2022) Structures of the Wild-Type and S59L Mutant CHCHD10 Proteins Important in Amyotrophic Lateral Sclerosis Frontotemporal Dementia

    Autor: ALICI HAKAN, N. Uversky Vladimir, Kang David E., Woo Junga Alexa, COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: ACS Chemical Neuroscience, Anzahl der Autoren: 5, Monat: April, Sprache: Englisch, Band: 13, Ausgabe: 8, Seite: 1273-1280, Doi: 10.1021/acschemneuro.2c00011, ISSN: 1948-7193, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: http://dx.doi.org/10.1021/acschemneuro.2c00011 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Fizik>Atom, Molekül ve Lazer Fiziği>Biyofizik, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2022) Intrinsically disordered proteins and proteins with intrinsically disordered regions in neurodegenerative diseases

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Mirzanli Ozan, Uversky Vladimir, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Biophysical Reviews, Anzahl der Autoren: 3, Monat: Januar, Sprache: Englisch, Band: 14, Doi: 10.1007/s12551-022-00968-0, ISSN: 1867-2450, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: http://dx.doi.org/10.1007/s12551-022-00968-0 , Fachwissen: Sağlık Bilimleri Temel Alanı>Nöroloji>GPCR, Artikeltyp: Rezension,

    (2021) Challenges and limitations in the studies of glycoproteins: A computational chemist's perspective

    Autor: Ballı Öykü İrem, Uversky Vladimir N., DURDAĞI SERDAR, COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, Anzahl der Autoren: 4, Monat: September, Sprache: Englisch, Doi: 10.1002/prot.26242, ISSN: 0887-3585, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: http://dx.doi.org/10.1002/prot.26242 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Biyoloji>Biyoteknoloji>Biyokimya>glikoproteinler, Artikeltyp: Rezension,

    (2021) Secondary structure dependence of amyloid\u2010β(1\u201340) on simulation techniques and force field parameters

    Autor: Caliskan Murat, Mandaci Sunay Y, Uversky Vladimir, COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Chemical Biology & Drug Design, Anzahl der Autoren: 4, Monat: Februar, Sprache: Englisch, Band: 97, Ausgabe: 5, Seite: 1100-1108, Doi: 10.1111/cbdd.13830, ISSN: 1747-0277","1747-0285, Zugangsart: Elektronisch, Artikellink: http://dx.doi.org/10.1111/cbdd.13830 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Biyoloji, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2021) Secondary structure dependence on simulation techniques and force field parameters: from disordered to ordered proteins

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Çağlayan Şule İrem, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Biophysical Reviews, Anzahl der Autoren: 2, Monat: Januar, Sprache: Englisch, Doi: 10.1007/s12551-021-00850-5, ISSN: 1867-2450, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: http://dx.doi.org/10.1007/s12551-021-00850-5 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Biyoloji>Biyokimya>Biyoteknoloji>ordered proteins, disordered proteins, force field parameters , Artikeltyp: Rezension,

    (2021) Structures of MERS-CoV macro domain in aqueous solution with dynamics: Impacts of parallel tempering simulation techniques and\n CHARMM36m\n and\n AMBER99SB\n force field parameters

    Autor: Akbayrak Ibrahim Yagiz, Caglayan Sule Irem, DURDAĞI SERDAR, Kurgan Lukasz, Uversky Vladimir N., Ulver Burak, Dervisoglu Havvanur, HAKLIDIR MEHMET, HASEKİOĞLU ORKUN, COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, Anzahl der Autoren: 10, Monat: Januar, Sprache: Englisch, Doi: 10.1002/prot.26150, ISSN: 0887-3585","1097-0134, Zugangsart: Elektronisch, Artikellink: http://dx.doi.org/10.1002/prot.26150 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Kimya>Fiziksel Kimya>Teorik Kimya>Biyokimya>MERS-CoV, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2020) Current Challenges and Limitations in the Studies of Intrinsically Disordered Proteins in Neurodegenerative Diseases by Computer Simulations

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Uversky Vladimir, Akbayrak Yagiz, Caglayan Sule, Özcan Zilan, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Current Alzheimer Research, Anzahl der Autoren: 5, Monat: Oktober, Sprache: Englisch, Sonderausgabe: Existiert nicht, Doi: 10.2174/1567205017666201109094908, ISSN: 1567-2050, Zugangsart: Printversion, Fachwissen: Sağlık Bilimleri Temel Alanı->Nöroloji, Artikeltyp: Rezension,

    (2020) Epitope region identification challenges of intrinsically disordered proteins in neurodegenerative diseases: Secondary structure dependence of α‐synuclein on simulation techniques and force field parameters

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Uversky Vladimir, Sariaslan M Furkan, Caliskan Murat, Mandaci Sunay Y, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Chemical Biology Drug Design, Anzahl der Autoren: 5, Monat: Januar, Sprache: Englisch, Sonderausgabe: Existiert nicht, ISSN: 1747-0277, Zugangsart: Elektronisch, Artikellink: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/cbdd.13662 , Artikeltyp: Originalartikel,

    (2019) Quantum Chemistry Meets Deep Learning for Complex Carbohydrate and Glycopeptide Species I

    Autor: HABİBOĞLU MEHMET GÖKHAN, COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Zeitschrift für Physikalische Chemie, Anzahl der Autoren: 2, Monat: April, Sprache: Englisch, Band: 233, Ausgabe: 4, Sonderausgabe: Existiert, Seite: 527-550, Doi: 10.1515/zpch-2018-1251, ISSN: 2196-7156, Zugangsart: Elektronisch, Artikellink: http://www.degruyter.com/view/j/zpch.2019.233.issue-4/zpch-2018-1251/zpch-2018-1251.xml , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2019) Transition Metal Ion Interactions with Disordered Amyloid-β Peptides in the Pathogenesis of Alzheimer’s Disease: Insights from Computational Chemistry Studies

    Autor: Strodel Birgit, COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Journal of Chemical Information and Modeling, Anzahl der Autoren: 2, Monat: März, Sprache: Englisch, Band: 59, Ausgabe: 5, Sonderausgabe: Existiert, Seite: 1782-1805, Doi: 10.1021/acs.jcim.8b00983, ISSN: 1549-9596, Zugangsart: Elektronisch, Artikellink: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.8b00983 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Rezension,

    (2019) Alanine Scanning Effects on the Biochemical and Biophysical Properties of Intrinsically Disordered Proteins: A Case Study of the Histidine to Alanine Mutations in Amyloid-beta(42)

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Uversky Vladimir, Indextyp: SCI, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Journal of Chemical Information and Modeling, Anzahl der Autoren: 2, Monat: Februar, Sprache: Englisch, Band: 59, Ausgabe: 2, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 871-884, Doi: 10.1021/acs.jcim.8b00926, ISSN: 1549-9596, Zugangsart: Printversion, Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2018) Insights into the Molecular Mechanisms of Alzheimer’s and Parkinson’s Diseases with Molecular Simulations: Understanding the Roles of Artificial and Pathological Missense Mutations in Intrinsically Disordered Proteins Related to Pathology

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Uversky Vladimir, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, Anzahl der Autoren: 2, Monat: Februar, Sprache: Englisch, Band: 19, Ausgabe: 2, Sonderausgabe: Existiert, Seite: 336-396, Doi: 10.3390/ijms19020336, ISSN: 1422-0067, Zugangsart: Elektronisch, Artikellink: http://www.mdpi.com/1422-0067/19/2/336 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Rezension,

    (2017) How accurate are your simulations? Effects of confined aqueous volume and AMBER FF99SB and CHARMM22/CMAP force field parameters on structural ensembles of intrinsically disordered proteins: Amyloid-β42 in water

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Vladimir Uversky, Indextyp: Endekste taranmıyor, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Intrinsically Disordered Proteins, Anzahl der Autoren: 2, Monat: Oktober, Sprache: Englisch, Band: 5, Ausgabe: 1, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 1377813-, Doi: 10.1080/21690707.2017.1377813, ISSN: 2169-0707, Zugangsart: Elektronisch, Artikellink: https://tandfonline.com/doi/abs/10.1080/21690707.2017.1377813 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2017) BMP-2 and BMP-9 binding specificities with ALK-3 in aqueous solution with dynamics

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Uversky Vladimir N., Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS MODELLING, Anzahl der Autoren: 2, Monat: August, Sprache: Englisch, Band: 77, Ausgabe: null, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 181-188, Doi: 10.1016/j.jmgm.2017.08.005, ISSN: 1093-3263, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S109332631730311X?via3Dihub , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2017) Tyrosine Regulates beta-Sheet Structure Formation in Amyloid-beta(42): A New Clustering Algorithm for Disordered Proteins

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Uversky Vladimir N., Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING, Anzahl der Autoren: 2, Monat: Juni, Sprache: Englisch, Band: 57, Ausgabe: 6, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 1342-1358, Doi: 10.1021/acs.jcim.6b00761, ISSN: 1549-9596, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.jcim.6b00761 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2016) Divalent copper ion bound amyloid-beta(40) and amyloid-beta(42) alloforms are less preferred than divalent zinc ion bound amyloid-beta(40) and amyloid-beta(42) alloforms

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: JOURNAL OF BIOLOGICAL INORGANIC CHEMISTRY, Anzahl der Autoren: 1, Monat: Dezember, Sprache: Englisch, Band: 21, Ausgabe: 8, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 957-973, Doi: 10.1007/s00775-016-1392-5, ISSN: 0949-8257, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://link.springer.com/article/10.10072Fs00775-016-1392-5 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2014) New force field parameters for metalloproteins I: Divalent copper ion centers including three histidine residues and an oxygen-ligated amino acid residue

    Autor: Wise Olivia, COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY, Anzahl der Autoren: 2, Monat: Juni, Sprache: Englisch, Band: 35, Ausgabe: 17, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 1278-1289, Doi: 10.1002/jcc.23622, ISSN: 0192-8651, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/jcc.23622 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2014) Adenosine Triphosphate (ATP) Reduces Amyloid-beta Protein Misfolding in vitro

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Murray Ian V. J., Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: JOURNAL OF ALZHEIMERS DISEASE, Anzahl der Autoren: 2, Monat: Februar, Sprache: Englisch, Band: 41, Ausgabe: 2, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 561-574, Doi: 10.3233/JAD-132300, ISSN: 1387-2877, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://content.iospress.com/articles/journal-of-alzheimers-disease/jad132300 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2013) Arginine and Disordered Amyloid-beta Peptide Structures: Molecular Level Insights into the Toxicity in Alzheimer’xxs Disease

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Wise-Scira Olivia, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: ACS CHEMICAL NEUROSCIENCE, Anzahl der Autoren: 2, Monat: Dezember, Sprache: Englisch, Band: 4, Ausgabe: 12, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 1549-1558, Doi: 10.1021/cn4001389, ISSN: 1948-7193, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/cn4001389 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2013) Structures and Free Energy Landscapes of the A53T Mutant-Type alpha-Synuclein Protein and Impact of A53T Mutation on the Structures of the Wild-Type alpha-Synuclein Protein with Dynamics

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Wise-Scira Olivia, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: ACS CHEMICAL NEUROSCIENCE, Anzahl der Autoren: 2, Monat: Juli, Sprache: Englisch, Band: 4, Ausgabe: 7, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 1101-1113, Doi: 10.1021/cn400041j, ISSN: 1948-7193, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/cn400041j , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2013) Structures and Free Energy Landscapes of the Wild-Type and A30P Mutant-Type alpha-Synuclein Proteins with Dynamics

    Autor: Wise-Scira Olivia, Aloglu Ahmet Kemal, Dunn Aquila, Sakallioglu Isin Tuna, COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: ACS CHEMICAL NEUROSCIENCE, Anzahl der Autoren: 5, Monat: März, Sprache: Englisch, Band: 4, Ausgabe: 3, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 486-497, Doi: 10.1021/cn300198q, ISSN: 1948-7193, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/cn300198q , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2013) Structures of the E46K Mutant-Type alpha-Synuclein Protein and Impact of E46K Mutation on the Structures of the Wild-Type alpha-Synuclein Protein

    Autor: Wise-Scira Olivia, Dunn Aquila, Aloglu Ahmet K., Sakallioglu Isin T., COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: ACS CHEMICAL NEUROSCIENCE, Anzahl der Autoren: 5, Monat: März, Sprache: Englisch, Band: 4, Ausgabe: 3, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 498-508, Doi: 10.1021/cn3002027, ISSN: 1948-7193, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/cn3002027 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2013) The Structures of the E22 Delta Mutant-Type Amyloid-beta Alloforms and the Impact of E22 Delta Mutation on the Structures of the Wild-Type Amyloid-beta Alloforms

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Wise-Scira Olivia, Perry George, Kitahara Taizo, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: ACS CHEMICAL NEUROSCIENCE, Anzahl der Autoren: 4, Monat: Februar, Sprache: Englisch, Band: 4, Ausgabe: 2, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 310-320, Doi: 10.1021/cn300149j, ISSN: 1948-7193, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/cn300149j , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2012) Structures and free energy landscapes of aqueous zinc(II)-bound amyloid-beta(1-40) and zinc(II)-bound amyloid-beta(1-42) with dynamics

    Autor: Wise-Scira Olivia, Xu Liang, Perry George, COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: JOURNAL OF BIOLOGICAL INORGANIC CHEMISTRY, Anzahl der Autoren: 4, Monat: August, Sprache: Englisch, Band: 17, Ausgabe: 6, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 927-938, Doi: 10.1007/s00775-012-0909-9, ISSN: 0949-8257, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://link.springer.com/article/10.10072Fs00775-012-0909-9 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2012) Probing and Trapping a Sensitive Conformation: Amyloid-beta Fibrils, Oligomers, and Dimers

    Autor: Fawver Janelle N., Duong Karen T., Wise-Scira Olivia, Chapa Rachel Petrofes, Schall Hayley E., COŞKUNER WEBER ORKİDE, Zhu Xiongwei, Colom Luis V., Murray Ian V. J., Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: JOURNAL OF ALZHEIMERS DISEASE, Anzahl der Autoren: 9, Monat: Juni, Sprache: Englisch, Band: 32, Ausgabe: 1, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 197-215, Doi: 10.3233/JAD-2012-120880, ISSN: 1387-2877, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://content.iospress.com/articles/journal-of-alzheimers-disease/jad120880 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2011) Amyloid-beta peptide structure in aqueous solution varies with fragment size

    Autor: Wise-Scira Olivia, Xu Liang, Kitahara Taizo, Perry George, COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, Anzahl der Autoren: 5, Monat: November, Sprache: Englisch, Band: 135, Ausgabe: 20, Sonderausgabe: Existiert nicht, Doi: 10.1063/1.3662490, ISSN: 0021-9606, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://aip.scitation.org/doi/10.1063/1.3662490 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2010) Single Ion and Dimerization Studies of the Al(III) Ion in Aqueous Solution

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY A, Anzahl der Autoren: 1, Monat: Oktober, Sprache: Englisch, Band: 114, Ausgabe: 41, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 10981-10987, Doi: 10.1021/jp102906c, ISSN: 1089-5639, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jp102906c , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2009) Dynamic and Structural Properties of Aqueous Arsenic Solutions

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Allison Thomas C., Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: CHEMPHYSCHEM, Anzahl der Autoren: 2, Monat: Juni, Sprache: Englisch, Band: 10, Ausgabe: 8, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 1187-1189, Doi: 10.1002/cphc.200800650, ISSN: 1439-4235, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/cphc.200800650 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Aufsatz,

    (2009) Identification of Active Sites of Biomolecules II: Saccharide and Transition Metal Ion in Aqueous Solution

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Bergeron Denis E., Rincon Luis, Hudgens Jeffrey W., Gonzalez Carlos A., Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY A, Anzahl der Autoren: 5, Monat: März, Sprache: Englisch, Band: 113, Ausgabe: 11, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 2491-2499, Doi: 10.1021/jp805747f, ISSN: 1089-5639, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jp805747f , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2008) Ligand exchange reactions in the formation of diphosphine-protected gold clusters

    Autor: Bergeron Denis E., COŞKUNER WEBER ORKİDE, Hudgens Jeffrey W., Gonzalez Carlos A., Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY C, Anzahl der Autoren: 4, Monat: August, Sprache: Englisch, Band: 112, Ausgabe: 33, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 12808-12814, Doi: 10.1021/jp804046e, ISSN: 1932-7447, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jp804046e , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2008) Glycosidic linkage conformation of methyl-alpha-mannopyranoside

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Bergeron Denis E., Rincon Luis, Hudgens Jeffrey W., Gonzalez Carlos A., Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, Anzahl der Autoren: 5, Monat: Juli, Sprache: Englisch, Band: 129, Ausgabe: 4, Sonderausgabe: Existiert nicht, Doi: 10.1063/1.2958916, ISSN: 0021-9606, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://aip.scitation.org/doi/10.1063/1.2958916 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2008) Identification of active sites of biomolecules. 1. Methyl-alpha-mannopyranoside and Fe-III

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Bergeron Denis E., Rincon Luis, Hudgens Jeffrey W., Gonzalez Carlos A., Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY A, Anzahl der Autoren: 5, Monat: April, Sprache: Englisch, Band: 112, Ausgabe: 13, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 2940-2947, Doi: 10.1021/jp711759q, ISSN: 1089-5639, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jp711759q , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2008) Coordination studies of Al-EDTA in aqueous solution

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Jarvis Emily A. A., Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY A, Anzahl der Autoren: 2, Monat: März, Sprache: Englisch, Band: 112, Ausgabe: 12, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 2628-2633, Doi: 10.1021/jp7098575, ISSN: 1089-5639, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jp7098575 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2007) Preferred conformation of the glycosidic linkage of methyl-beta-mannose

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS, Anzahl der Autoren: 1, Monat: Juli, Sprache: Englisch, Band: 127, Ausgabe: 1, Sonderausgabe: Existiert nicht, Doi: 10.1063/1.2747238, ISSN: 0021-9606, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://aip.scitation.org/doi/10.1063/1.2747238 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2007) Water dissociation in the presence of metal ions

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Jarvis Emily A. A., Allison Thomas C., Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, Anzahl der Autoren: 3, Monat: Mai, Sprache: Englisch, Band: 46, Ausgabe: 41, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 7853-7855, Doi: 10.1002/anie.200701617, ISSN: 1433-7851, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.200701617 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Aufsatz,

    (2007) Hydrophobic interactions of xenon by Monte Carlo simulations

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Ulrich Deiters, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: ZEITSCHRIFT FUR PHYSIKALISCHE CHEMIE-INTERNATIONAL JOURNAL OF RESEARCH IN PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS, Anzahl der Autoren: 2, Monat: April, Sprache: Englisch, Band: 221, Ausgabe: 6, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 785-799, Doi: 10.1524/zpch.2007.221.6.785, ISSN: 0942-9352, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://www.degruyter.com/view/j/zpch.2007.221.issue-6/zpch.2007.221.6.785/zpch.2007.221.6.785.xml?format=INT , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2006) Hydrophobic interactions by Monte Carlo simulations

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Ulrich Deiters, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: ZEITSCHRIFT FUR PHYSIKALISCHE CHEMIE-INTERNATIONAL JOURNAL OF RESEARCH IN PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS, Anzahl der Autoren: 2, Monat: August, Sprache: Englisch, Band: 220, Ausgabe: 3, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 349-369, Doi: 10.1524/zpch.2006.220.3.349, ISSN: 0942-9352, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://www.degruyter.com/view/j/zpch.2006.220.3.349/zpch.2006.220.3.349.xml , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

    National

    (2018) Revisiting Cu(II) Bound Amyloid-β40 and Amyloid-β42 Peptides: Varying Coordination Chemistries

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: TR DİZİN, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Journal of the Turkish Chemical Society, Section A: Chemistry, Anzahl der Autoren: 1, Monat: August, Sprache: Türkisch, Band: 5, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 981-1008, Doi: 10.18596/jotcsa.424144, ISSN: 2149-0120, Zugangsart: Elektronisch, Artikellink: http://dergipark.gov.tr/doi/10.18596/jotcsa.424144 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->Kimya, Artikeltyp: Originalartikel,

Administrative Aufgaben

2023 30/12/9999

Fakülte Yönetim Kurulu Üyeliği

TÜRK-ALMAN ÜNİVERSİTESİ, TÜRKİYE
2020 2023

Bölüm Başkanı

TÜRK-ALMAN ÜNİVERSİTESİ, TÜRKİYE
2018 30/12/9999

Anabilim Dalı Başkanı

TÜRK-ALMAN ÜNİVERSİTESİ, TÜRKİYE
2018 2018

Komisyon Üyeliği

FEN FAKÜLTESİ
TÜRK-ALMAN ÜNİVERSİTESİ, TÜRKİYE
2011 2012

Komisyon Üyeliği

Sciences
University of Texas at San Antonio, AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ
2009 2014

Komisyon Üyeliği

Sciences
University of Texas at San Antonio, AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ

Berufserfahrungen

2019 2019

Bursiyer

DAAD Bursiyeri
2003 2009

Guest Scientist

National Institute of Standards and Technology

Kontakt

Kontaktinformationen

E-Mail: weber@tau.edu.tr


Büro Telefonnummer: : +902163333337