APBS

Wiss. Mitarb.
Semih ALPSOY

Fakultät für Naturwissenschaften

Molekulare Biotechnologie

Lebenslauf

Ausbildung

2019 -
Doktor

ACIBADEM MEHMET ALİ AYDINLAR ÜNİVERSİTESİ

SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, BİYOİSTATİSTİK VE BİYOİNFORMATİK (DR) (İNGİLİZCE)
2017 - 2019
Doktor

ACIBADEM MEHMET ALİ AYDINLAR ÜNİVERSİTESİ

SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, MEDİKAL BİYOTEKNOLOJİ (DR)
2013 - 2017
Master

ORTA DOĞU TEKNİK ÜNİVERSİTESİ

ENFORMATİK ENSTİTÜSÜ, SAĞLIK BİLİŞİMİ ANABİLİM DALI (DİSİPLİNLERARASI)
2009 - 2013
Bachelor

ORTA DOĞU TEKNİK ÜNİVERSİTESİ

FEN-EDEBİYAT FAKÜLTESİ, BİYOLOJİK BİLİMLER BÖLÜMÜ

Akademischer Titel

2017
Wissenschaftliche (r) Mitarbeiter (in)

TÜRK-ALMAN ÜNİVERSİTESİ, TÜRKİYE

FEN FAKÜLTESİ, MOLEKÜLER BİYOTEKNOLOJİ BÖLÜMÜ

Akademische Studien

  • International

    (2025) Transfer learning with multiomics integration and deep neural networks reveals drug resistance mechanisms in cancer

    Autor: ALPSOY SEMİH, SEZERMAN OSMAN UĞUR, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Scientific Reports, Anzahl der Autoren: 2, Monat: November, Sprache: Englisch, Band: 15, Ausgabe: 1, Seite: 42295-, Doi: 10.1038/s41598-025-23435-8, ISSN: 2045-2322, Zugangsart: Elektronisch, Artikellink: https://www.nature.com/articles/s41598-025-23435-8 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Biyoloji>Biyoenformatik>Genetik, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2025) Three new Microbacterium species isolated from the Marmara Sea mucilage event: Microbacterium istanbulense sp. nov., Microbacterium bandirmense sp. nov., Microbacterium marmarense sp. nov

    Autor: SATICIOĞLU İZZET BURÇİN, AJMI NIHED, COŞKUNER WEBER ORKİDE, ALPSOY SEMİH, AY HİLAL, AYDIN FUAT, ABAY SEÇİL, KARAKAYA EMRE, KAYMAN TUBA, DALYAN CEM, KOCA FATİH DOĞAN, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Systematic and Applied Microbiology, Anzahl der Autoren: 11, Monat: Mai, Sprache: Englisch, Band: 48, Ausgabe: 3, Doi: 10.1016/j.syapm.2025.126600, ISSN: 0723-2020, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0723202025000220 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Biyoloji>Mikrobiyoloji>Biyoenformatik>Genetik, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2025) Metagenomics studies in aquaculture systems: Big data analysis, bioinformatics, machine learning and quantum computing

    Autor: COŞKUNER WEBER ORKİDE, ALPSOY SEMİH, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Computational Biology and Chemistry, Anzahl der Autoren: 2, Monat: April, Sprache: Englisch, Band: 118, Doi: 10.1016/j.compbiolchem.2025.108444, ISSN: 1476-9271, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1476927125001045 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Moleküler Biyoloji ve Genetik>Mikrobiyoloji>Biyoenformatik>Genetik, Artikeltyp: Rezension,

    (2024) Key genes and pathways in the molecular landscape of pancreatic ductal adenocarcinoma: A bioinformatics and machine learning study

    Autor: ALPSOY SEMİH, COŞKUNER WEBER ORKİDE, Indextyp: SCI-Expanded kapsamındaki dergilerde yayımlanmış tam makale, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Computational Biology and Chemistry, Anzahl der Autoren: 2, Monat: Dezember, Sprache: Türkisch, Band: 113, Doi: 10.1016/j.compbiolchem.2024.108268, ISSN: 1476-9271, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1476927124002561 , Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Moleküler Biyoloji ve Genetik>Biyoenformatik>Genetik, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2019) 3In-silico Prediction of Synergistic Anti-Cancer Drug Combinations Using Multi-omics Data

    Autor: ÇELEBİ REMZİ, Walk Oliver Bear Don’xxt, Movva Rajiv, ALPSOY SEMİH, Dumontier Michel, Indextyp: SCI, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: SCIENTIFIC REPORTS, Anzahl der Autoren: 5, Monat: Juni, Sprache: Englisch, Band: 9, Ausgabe: null, Sonderausgabe: Existiert nicht, Doi: 10.1038/s41598-019-45236-6, ISSN: 2045-2322, Zugangsart: Printversion, Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı->İstatistik, Artikeltyp: Originalartikel,

    (2016) Expression Profiles of the Individual Genes Corresponding to the Genes Generated by Cytotoxicity Experiments with Bortezomib in Multiple Myeloma

    Autor: Ghasemi Mehdi, ALPSOY SEMİH, Türk Seyhan, Malkan Ümit, Atakan Şükrü, HAZNEDAROĞLU İBRAHİM CELALETTİN, GÜNEŞ GÜRSEL, Gündüz Mehmet, Yılmaz Burak, ETGÜL SEZGİN, AYDIN MÜRÜVVET SEDA, Aslan Tuncay, SAYINALP NİLGÜN, AKSU SALİH, DEMİROĞLU HALUK, ÖZCEBE OSMAN İLHAMİ, GÖKER HAKAN, Indextyp: TR DİZİN, Type: people.with_referee, Name der Fachzeitschrift: Turkish Journal of Hematology, Anzahl der Autoren: 17, Monat: Februar, Sprache: Englisch, Band: 33, Ausgabe: 4, Sonderausgabe: Existiert nicht, Seite: 286-292, Doi: 10.4274, ISSN: 1300-7777, Zugangsart: Printversion+Elektronisch, Artikellink: http://www.tjh.com.tr/jvi.aspx?pdir=tjhplng=engun=TJH-98105 , Fachwissen: Sağlık Bilimleri Temel Alanı->İç Hastalıkları, Artikeltyp: Originalartikel,

  • National

    In-silico Prediction and In-vitro Validation of Chemosensitivity to Bortezomib in Multiple Myeloma Cell Lines.

    Autor: Ghasemi Mehdi, TÜRK SEYHAN, ALPSOY SEMİH, CAN Sultan Nilay, HAZNEDAROĞLU İBRAHİM CELALETTİN, GÜRE ALİ OSMAY, Type: Zusammenfassender Bericht, Veranstaltungsname: IV. Uluslararası Türkiye Moleküler Biyoloji Derneği Kongresi, Startdatum der Veranstaltung: 27/11/2015, Anzahl der Autoren: 6, Sprache: Englisch, Status der Veröffentlichung: Veröffentlicht, Veröffentlichungsdatum: 30/11/2015, Sonderausgabe: Existiert nicht, Zugangsart: Printversion, Land: , Stadt: Ankara, Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Moleküler Biyoloji ve Genetik>Moleküler Biyoloji>Genetik>Bakteriyoloji>Biyoinformatik,

    Predicting the Progression of Subclinical MGUS to Clinically Active MM in Multiple Myeloma

    Type: Volltextpapier, Veranstaltungsname: IV. Uluslararası Türkiye Moleküler Biyoloji Derneği Kongresi, Startdatum der Veranstaltung: 27/11/2015, Enddatum der Veranstaltung: 29/11/2015, Anzahl der Autoren: 5, Sprache: Englisch, Status der Veröffentlichung: Veröffentlicht, Veröffentlichungsdatum: 29/11/2015, Sonderausgabe: Existiert nicht, Zugangsart: Printversion, Land: , Stadt: Ankara, Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Moleküler Biyoloji ve Genetik>Moleküler Biyoloji>Genetik>Biyoteknoloji>Biyoinformatik,

    Prediction of Transition from Subclinical MGUS to Clinically Active MM in Multiple Myeloma

    Type: Zusammenfassender Bericht, Veranstaltungsname: IV. Uluslararası Türkiye Moleküler Biyoloji Derneği Kongresi, Startdatum der Veranstaltung: 27/11/2015, Enddatum der Veranstaltung: 29/11/2015, Anzahl der Autoren: 5, Sprache: Englisch, Status der Veröffentlichung: Veröffentlicht, Veröffentlichungsdatum: 29/11/2015, Sonderausgabe: Existiert nicht, Zugangsart: Printversion, Land: , Stadt: Ankara, Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>Moleküler Biyoloji ve Genetik>Moleküler Biyoloji>Genetik>Biyoteknoloji>Biyoinformatik,

    Drug Selection for Malignant Melanoma Using Biomarkers Generated by Weighted Gene Co-Expression Network Analysis (WGCNA).

    Autor: ALPSOY SEMİH, ACAR AYBAR CAN, GÜRE ALİ OSMAY, Type: Zusammenfassender Bericht, Veranstaltungsname: 9. Uluslararası Sağlık Bilişimi ve Biyoinformatik Sempozyumu, Startdatum der Veranstaltung: 16/10/2015, Anzahl der Autoren: 3, Sprache: Englisch, Status der Veröffentlichung: Veröffentlicht, Veröffentlichungsdatum: 17/10/2015, Sonderausgabe: Existiert nicht, Zugangsart: Elektronisch, Artikellink: http://hibit2015.mu.edu.tr/ , Land: , Stadt: Muğla, Fachwissen: Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı>İstatistik>Biyo-enformatik>Veri Madenciliği>Yapay Zeka>Moleküler Biyoloji,

  • (2016) AstraZeneca - Sanger İlaç Kombinasyon Tahmini DREAM Yarışması Finalisti

    Aktivitätsdetail: Diğer, Beschreibung: İlaç kombinasyonlarının etkinliğini belirlemek için yapay zeka yöntemleriyle istatistiksel modeller geliştirerek finalistliğin elde edilmesi, Einrichtung: AstraZeneca, Land: ,

    (2016) Yeni Fikirler Yeni İşler Yarışması Finalisti

    Aktivitätsdetail: Diğer, Beschreibung: ODTÜ Teknokent' in her sene en iyi girişimleri seçtiği yarışmada finalistlik, Einrichtung: ORTA DOĞU TEKNİK ÜNİVERSİTESİ, Institution: ORTA DOĞU TEKNİK ÜNİVERSİTESİ, Land: ,

    (2015) Teknogirişim Destek Programı

    Aktivitätsdetail: Diğer, Beschreibung: 100.000 TL destekli ödül girişimci gençlere şirket kurmaları için verilidi, Einrichtung: BİLİM SANAYİ VE TEKNOLOJİ BAKANLIĞI, Institution: BİLİM SANAYİ VE TEKNOLOJİ BAKANLIĞI, Land: ,

    (2011) Uluslararası Genetiği Değiştirilmiş Makine (iGEM) Yarışması En İyi Yazılımı Kullanan 2. Grup

    Aktivitätsdetail: Diğer, Beschreibung: Uluslararası Genetiği Değiştirilmiş Makine (iGEM) Yarışması' nda 'Mining for BioBricks' projesiyle Avrupa elemelerinde gümüş madalya ve tüm yarışmacılar arasında yazılımı en iyi kullanan 2. grup , Einrichtung: Massachusetts Institute of Technology, Land: ,

Berufserfahrungen

2015 2017

Şirket ortağı

GenPrint Tedavi Öngörü Tanı ve Laboratuvar Hizmetleri Ltd. Şti.
2015 2017

Şirket sahibi ve yöneticisi

Odak Tedavi Öngörü Tanı ve Laboratuvar Hizmetleri Ltd. Şti.

Fachgebiet

  1. Fen Bilimleri ve Matematik Temel Alanı - Biyoloji (Biyo-enformatik, Biyoteknoloji, Moleküler Biyoloji)

Kontakt

Kontaktinformationen

E-Mail: alpsoy@tau.edu.tr

Alternative E-Mail: alpsoysemih@gmail.com


Büro Adresse: : Fen Fakültesi, Moleküler Biyoteknoloji Bölümü, 2. Kat

Büro Telefonnummer: : +902163333344

Internal: : 3344

Zimmernummer: : 238